Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold1P52431 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold1P52431 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold1P52431 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms