Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms