Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RorcP51450 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RorcP51450 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RorcP51450 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RorcP51450 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RorcP51450 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RorcP51450 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RorcP51450 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RorcP51450 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RorcP51450 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RorcP51450 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RorcP51450 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RorcP51450 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms