Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms