Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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