Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GdnfP48540 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GdnfP48540 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GdnfP48540 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GdnfP48540 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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