Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms