Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox2P48432 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms