Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms