Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfaP48030 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfaP48030 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfaP48030 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfaP48030 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfaP48030 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfaP48030 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfaP48030 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfaP48030 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms