Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrprbP47758 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms