Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic1P46684 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic1P46684 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zic1P46684 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zic1P46684 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms