Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms