Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PtgfrP43117 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtgfrP43117 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtgfrP43117 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtgfrP43117 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtgfrP43117 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtgfrP43117 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtgfrP43117 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms