Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkx2-5P42582 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-5P42582 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms