Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3caP42337 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pik3caP42337 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms