Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp9P41245 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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