Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TfamP40630 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TfamP40630 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TfamP40630 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TfamP40630 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TfamP40630 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TfamP40630 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms