Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd1P40201 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd1P40201 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms