Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms