Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn1P35821 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptpn1P35821 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms