Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms