Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpardP35396 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpardP35396 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpardP35396 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpardP35396 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpardP35396 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpardP35396 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpardP35396 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpardP35396 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpardP35396 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms