Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms