Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn11P35235 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms