Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms