Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pola2P33611 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms