Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms