Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsx2P31316 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms