Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VtnP29788 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VtnP29788 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VtnP29788 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VtnP29788 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms