Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcdP28867 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms