Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprmP28828 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprmP28828 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms