Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms