Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb1P28230 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms