Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2-DMaP28078 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2-DMaP28078 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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