Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms