Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde6aP27664 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms