Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms