Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U2af2P26369 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms