Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms