Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1bP25119 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1bP25119 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms