Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3aP23116 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3aP23116 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms