Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpcP21841 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms