Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcb1aP21447 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcb1aP21447 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcb1aP21447 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcb1aP21447 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abcb1aP21447 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcb1aP21447 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms