Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VimP20152 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VimP20152 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VimP20152 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VimP20152 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms