Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P20040 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P20040 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P20040 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P20040 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P20040 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P20040 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P20040 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P20040 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms