Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms