Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18532 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18532 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18532 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18532 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18532 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18532 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18532 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18532 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18532 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18532 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms