Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18526 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18526 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18526 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18526 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18526 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18526 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18526 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18526 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms