Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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